ClustalW es un práctico, fácil de utilizar, herramienta diseñada especialmente para ayudarle con la alineación múltiple de las secuencias del ácido nucléico y de la proteína.
La secuencia entró: todas las secuencias deben estar en 1 archivo, uno tras otro. 7 formatos se reconocen automáticamente: Fichero " plano " de NBRF-PIR, de EMBL-SWISSPROT, de Pearson (Fasta), de Clustal (*.aln), de GCG-MSF (choque múltiple), de GCG9-RSF y de GDE. Todos los carácteres no alfabéticos (espacios, dígitos, signos de puntuación) se no hacen caso excepto “-” que se utiliza para indicar GAP (“.” en MSF-RSF).
