Le contrôleur de génotype de ResSpecies est un outil de bureau pour identifier des erreurs de données probables dans des ensembles de données de pedigree/génotype et pour aider le nettoyage de données.
Les erreurs de Datapoint dans des ensembles de données de pure race de génotype sont difficiles d'identifier et compromettre des analyses génétiques descendant. Les erreurs qui sont contradictoires avec les règles de la transmission mendélienne typiquement infirment des algorithmes d'analyse de tringlerie, et font échouer de telles analyses. Les erreurs de génotype peuvent résulter d'un variery des erreurs systématiques ou sporadiques dans l'analyse genotyping, ou en enregistrant l'information de pedigree ou de génotype.
En appliquant un algorithme de transmission-vérification pour des marqueurs à travers le pedigree et en visualisant les données de transmission dans une interface utilisateurs exploratoire, GenotypeChecker permet les sources de contradiction de données peut être resolved.
GenotypeChecker montre les génotypes de marqueur pour des individus dans le pedigree en forme de tableaux (individuel contre le marqueur). Appliquant l'algorithme de transmission-vérification à travers le pedigree pour chaque marqueur implique des données absentes de génotype et accentue les génotypes qui ne sont pas compatibles à la règle de base que le génotype d'une progéniture doit dériver des allèles hérités de chaque parent. Donner à contrôleur de génotype de ResSpecies un essai pour évaluer entièrement ses possibilités !
Conditions :
· Java
