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AsymmetryCounter

Contar el número de substituciones en cada dirección para los pares de los aminoácidos.

AsymmetryCounter es un aviso pequeño, de comando basado diseñado especialmente para tomar el archivo de las secuencias alineadas producidas por AmbiguityRemover y cuentas, para cada par de aminoácidos, el número de substituciones en cada dirección.

Compara el cociente de substituciones en una dirección y las substituciones en la dirección opuesta al cociente previsto del 1:1 usar calidad-de-caben la prueba. Si un par de aminoácidos tiene menos de 50 substituciones totales, se utiliza la prueba binomial exacta y se divulga el P-valor; si hay 50 o más substituciones, la G-prueba de calidad-de-cupo se utiliza y se divulgan el coeficiente y el P-valor. Si el coeficiente es mayor de 454, se da el P-valor como “

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