PROTTEST (pariente de ModelTest) es un programa para seleccionar el modelo de la evolución de la proteína que el mejor cabe un sistema dado de las secuencias (alineación). Los modelos incluidos son matrices empíricas de la substitución (tales como MENEO, LG, mtREV, Dayhoff, DCMut, JTT, VT, Blosum62, CpREV, RtREV, MtMam, MtArt, HIVb, e HIVw) que indica índices relativos de reemplazo del aminoácido, y las mejoras específicas (+I: sitios invariables, +G: heterogeneidad de la tarifa entre los sitios, +F: las frecuencias observadas del aminoácido) para explicar los apremios evolutivos impossed por la conservación de la estructura y de la función de la proteína. ProtTest utiliza el criterio de información de Akaike (AIC) y otras estadísticas (AICc y el Bic) para encontrar cuál del candidato modela ajustes del mejor los datos actuales. ¡Dar a ProtTest un intento para determinar completamente sus capacidades!
